一、办公室
二、人事科(离退休干部管理办公室)
三、党群工作科
四、财务与审计科
五、总务药械科
六、业务管理科(应急管理办公室)
七、传染病防治科
八、慢性非传染性疾病防制科(地方病防制科)
九、免疫预防管理科(生物制品管理办公室)
十、艾滋病防治科
十一、病媒生物防制与消杀科
十二、职业病防治科
十三、食品营养与环境卫生监测科
十四、健康教育科
十五、学校卫生科
十六、病原微生物检验科
十七、理化检验科
十八、基本公共卫生服务项目指导科
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